Realmente, minha bicimoto esses dias estava com carburador entupido eu acho, ela não corria muito e apagava , depois ela corria mas dava umas falhada. Não sei se foi por esse motivo mas acho que foi.
Talvez seu carburador esteja realmente entupido afinal como você disse você utilizou 3 tanques sem o filtro. Agora só limpando o carburador para que o desempenho volte ao normal. Caso não esteja familiarizado com carburadores melhor procurar um mecânico para executar o serviço.